A Secretaria Acadêmica existe para atendimento às pessoas (pais, alunos, professores e comunidade em geral) de modo a satisfazer suas necessidades em relação aos serviços prestados por ela. É o órgão responsável pela escrituração escolar, pela expedição e registro de documentos escolares, planejamento e controle dos processos e resultados do ensino e da aprendizagem.

Para auxiliar a Direção, Diretoria de Serviço e a Secretaria Acadêmica foi implantado no ano de 2007 o Protocolo. Documentos a serem solicitados via Protocolo: Declaração de Escolaridade, Declaração de Conclusão (CREA, COREN, CRQ, CRN), 2ª via de Histórico e de Diploma, Transferência, Solicitação de Estágio, Reclassificação, Aproveitamento de Estudos, Trancamento de Matrícula, carimbo no controle de passe escolar.

O Professor também utiliza o Protocolo para a entrega de planilhas das Bases Tecnológicas e dos Planos de Trabalho Docente.